30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4003 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  350  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  69.33 
 
 		 174 aa  244  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  63.92 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  63.92 
 
 		 188 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  62.35 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  64.94 
 
 		 209 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  62.96 
 
 		 209 aa  220  6e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  64.29 
 
 		 189 aa  220  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  64.05 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  64.29 
 
 		 203 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  45.12 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  47.53 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.3 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  49.38 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  43.75 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  40.85 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  38.85 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  39.61 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  38.85 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  38.51 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  36.31 
 
 		 187 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  36.31 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  36.13 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  36.31 
 
 		 187 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  36.54 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  36.42 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  35.48 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  28.3 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  30.95 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>