30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0953 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  98.09 
 
 
209 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  95.22 
 
 
203 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  93.85 
 
 
189 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  81.68 
 
 
190 aa  315  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  77.22 
 
 
186 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  71.65 
 
 
188 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  67.1 
 
 
174 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  62.96 
 
 
168 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  62.58 
 
 
184 aa  215  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  51.59 
 
 
167 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.43 
 
 
171 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  49.68 
 
 
177 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  46.71 
 
 
168 aa  154  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  45 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  38.51 
 
 
164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  40.54 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  40.54 
 
 
187 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  35.85 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  38.22 
 
 
164 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  34.36 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  36.62 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  35.21 
 
 
166 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  39.26 
 
 
176 aa  106  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  36.88 
 
 
171 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  33.54 
 
 
175 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  32.12 
 
 
178 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  31.65 
 
 
177 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  28.22 
 
 
170 aa  87  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>