30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0383 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  42.14 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  44.08 
 
 
181 aa  145  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  44.08 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  44.08 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  47.17 
 
 
176 aa  144  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  40.88 
 
 
164 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  48.12 
 
 
171 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  40.38 
 
 
166 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  41.72 
 
 
175 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  40.38 
 
 
166 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  41.56 
 
 
178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  40.38 
 
 
175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  35.29 
 
 
177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  36.59 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  36.36 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  36.14 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  33.94 
 
 
170 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  37.01 
 
 
167 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  35.85 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  35.22 
 
 
209 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  35.22 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  35.44 
 
 
189 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  33.77 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.12 
 
 
171 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  33.73 
 
 
177 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  38.76 
 
 
168 aa  104  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  32.9 
 
 
184 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  32.67 
 
 
164 aa  100  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  35 
 
 
168 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.426108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>