34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3326 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3326  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  357  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.120609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4003  hypothetical protein  69.33 
 
 
168 aa  244  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.426108 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1055  hypothetical protein  68.39 
 
 
209 aa  235  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3668  hypothetical protein  68.59 
 
 
186 aa  233  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0967  hypothetical protein  68.18 
 
 
190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3337  protein of unknown function DUF1008  67.1 
 
 
189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0207771  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0953  hypothetical protein  67.1 
 
 
209 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1022  hypothetical protein  67.1 
 
 
203 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0950175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3234  heme utilization protein HuvX  67.72 
 
 
188 aa  228  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00279446  normal  0.899142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0791  hypothetical protein  58.58 
 
 
184 aa  218  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0329  hutX protein  52.83 
 
 
167 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0562944  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1749  heme uptake and utilization protein HuvX  52.23 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001357  putative heme iron utilization protein  49.38 
 
 
177 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05246  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  47.17 
 
 
171 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0723  heme utilization protein HuvX  43.04 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3798  hypothetical protein  42.95 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0255184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0653  hypothetical protein  42.95 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.80145  normal  0.286593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3886  hypothetical protein  42.95 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0909585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2356  hypothetical protein  37.2 
 
 
175 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0624105  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2417  protein of unknown function DUF1008  37.2 
 
 
178 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0160  hypothetical protein  35.85 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1975  hypothetical protein  35.48 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157638  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4863  hypothetical protein  37.66 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.338435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2326  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0409138  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1520  protein of unknown function DUF1008  37.01 
 
 
166 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.416519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3806  hypothetical protein  37.42 
 
 
164 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0394608 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2749  hypothetical protein  37.01 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0383  hypothetical protein  33.77 
 
 
185 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2043  HuvX protein  33.93 
 
 
170 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2731  hypothetical protein  29.81 
 
 
177 aa  98.2  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3801  hemin transport protein HmuS  27.4 
 
 
342 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.189206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2168  hemin-degrading family protein  28.91 
 
 
344 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41951  normal  0.140472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4856  hemin transport protein HmuS  26.71 
 
 
342 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2036  Hemin-degrading family protein  28.08 
 
 
346 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>