More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1089 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1089  glutamate--ammonia ligase  100 
 
 		 425 aa  854    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  34.75 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  33.79 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1609  L-glutamine synthetase  34.59 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  33.78 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  33.93 
 
 		 447 aa  219  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  33.78 
 
 		 442 aa  216  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1098  glutamate--ammonia ligase  33.18 
 
 		 433 aa  216  4e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.193813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  35.15 
 
 		 447 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  33.7 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  32.08 
 
 		 446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  32.59 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  33.18 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  35.45 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0242  glutamine synthetase catalytic region  33.55 
 
 		 447 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0456  glutamine synthetase catalytic region  34.17 
 
 		 431 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000119779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  33.99 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  33.33 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  32.08 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  34.23 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0144  glutamate--ammonia ligase  33.94 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  32.08 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  32.67 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 441 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  33.63 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  32.81 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  32.81 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  31.82 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3398  glutamine synthetase catalytic region  32.67 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  32.31 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  32.88 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  33.72 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  33.41 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  33.41 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  31.75 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  34.4 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  31.91 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  34.3 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  33.03 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  33.18 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  32.82 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  32.29 
 
 		 443 aa  202  8e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 		 444 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  32.06 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  33.26 
 
 		 442 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  32.44 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  32.96 
 
 		 444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07430  L-glutamine synthetase  33.5 
 
 		 447 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  32.01 
 
 		 442 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  31.33 
 
 		 456 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  30.93 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  34.17 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  30.96 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1766  glutamine synthetase catalytic region  32.95 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.98432 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  30.44 
 
 		 461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  32.27 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  31.74 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  32.88 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  31.15 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  31.56 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13430  L-glutamine synthetase  31.17 
 
 		 446 aa  194  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0720784  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  31.4 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  31.53 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  31.11 
 
 		 440 aa  192  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  32.8 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  33.25 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  29.98 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  30.32 
 
 		 443 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  31.24 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1849  glutamine synthetase, type I  31.33 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  30.79 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  31.79 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1591  glutamine synthetase, type I  31.01 
 
 		 446 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000014184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  31.94 
 
 		 449 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  32.6 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  32 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3584  glutamine synthetase, type I  31.71 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  31.24 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  31.57 
 
 		 453 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  32.44 
 
 		 446 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2016  glutamine synthetase, type I  32.07 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  hitchhiker  0.0000000000000396297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  29.51 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  32 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  30.96 
 
 		 447 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3296  glutamine synthetase, type I  32.43 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.405518  normal  0.0478634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  30.96 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  30.89 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  31.22 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  31.39 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  31.43 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3339  glutamine synthetase, type I  30.82 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.301848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>