24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0582 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0582  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  100 
 
 		 237 aa  461  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0366  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  45.45 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0076  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  40.69 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141072  hitchhiker  0.00451109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1793  K-like, type 1, subgroup  42.86 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0837  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  45.74 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.628304  normal  0.123763 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0431  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  39.56 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0115724 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0934  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  42.29 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1936  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  41.3 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0183  K-like, type 1, subgroup  43.24 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000922938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1363  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  41.15 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1382  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  44.25 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2505  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  39.37 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00658393  normal  0.379662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0198  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  31.82 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000947081  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00790  exosome complex exonuclease rrp4, putative  28.64 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.937014  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31470  predicted protein  26.98 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10406  exosome complex exonuclease Rrp4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05860)  24.53 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.674842  normal  0.0792702 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  33.06 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  40.28 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3514  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.3 
 
 		 772 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1497  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.88 
 
 		 767 aa  42.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  26.98 
 
 		 178 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2763  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30 
 
 		 698 aa  42.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38656  predicted protein  29.17 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3785  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.85 
 
 		 708 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.668029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>