26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1363 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1363  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  100 
 
 		 221 aa  443  1e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0198  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  54.67 
 
 		 263 aa  258  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000947081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2505  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  56.11 
 
 		 260 aa  254  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00658393  normal  0.379662 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0183  K-like, type 1, subgroup  44.91 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000922938  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0582  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  41.15 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0934  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  39.11 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0366  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  41.45 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0837  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  40.65 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.628304  normal  0.123763 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1936  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  36.44 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0076  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  37.05 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141072  hitchhiker  0.00451109 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1793  K-like, type 1, subgroup  37.27 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0431  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  38.43 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0115724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1382  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  38.33 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31470  predicted protein  24.88 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00790  exosome complex exonuclease rrp4, putative  28.65 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.937014  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38656  predicted protein  29.8 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34164  Exosome complex exonuclease RRP40 (Ribosomal RNA processing protein 40)  25 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3324  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.43 
 
 		 775 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.109983  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2478  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  28.24 
 
 		 744 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0963383  normal  0.320365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23380  guanosine pentaphosphate synthetase I/polynucleotide phosphorylase  33.33 
 
 		 735 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0262857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0035  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.21 
 
 		 791 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1518  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.21 
 
 		 744 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.734214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.58 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1217  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.67 
 
 		 744 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.118879  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07100  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  27.19 
 
 		 753 aa  41.6  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0664507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3968  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.08 
 
 		 514 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507698  normal  0.122374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>