20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4143 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  584  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  63.64 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  45.57 
 
 
483 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  39.84 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  37.31 
 
 
290 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  35.71 
 
 
268 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  37.44 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  35.63 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  33.9 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  42.13 
 
 
442 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  33.94 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  34.36 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  32.05 
 
 
266 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  42.31 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  36.88 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  31.31 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  37.85 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  33.14 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  36.55 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  31.76 
 
 
251 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>