20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0670 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  38.11 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  37.74 
 
 
266 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  37.69 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  34.27 
 
 
282 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  33.09 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  34.63 
 
 
259 aa  85.5  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  38.46 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  36.36 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  40.91 
 
 
483 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  32.44 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  35.54 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  33.2 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  36.57 
 
 
277 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  35.63 
 
 
442 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  52.24 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  33.33 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  26.53 
 
 
397 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  42.17 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>