19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4030 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  531  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  38.34 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  40.91 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  37.15 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  42.5 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  31.91 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  44.09 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  34.34 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  34.15 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  36.43 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  30.42 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  30.6 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  33.85 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  29.59 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  32.48 
 
 		 442 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  30.59 
 
 		 537 aa  45.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  29.15 
 
 		 266 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>