19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1305 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  487  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  63.64 
 
 
306 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  48.28 
 
 
483 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  42.28 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  36.65 
 
 
290 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  32.68 
 
 
268 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  32.84 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  34.43 
 
 
277 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  35.52 
 
 
275 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  33.72 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  32.03 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  44 
 
 
270 aa  79  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  42.07 
 
 
442 aa  78.6  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  31.25 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  35.15 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  36.31 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  36.47 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  36.3 
 
 
280 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>