15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4458 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  95.49 
 
 		 266 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  38.43 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  35.82 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  34.84 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  37.74 
 
 		 270 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  37.14 
 
 		 259 aa  99  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  38.73 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  34.36 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  32.03 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  36.88 
 
 		 483 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  36.41 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  34.34 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  33.52 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  28.44 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>