20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1540 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  41.57 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  35.71 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  32.68 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  32.82 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  35.58 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  32.65 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  38.82 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  37.95 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  32.08 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  27.17 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  32.49 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  31.22 
 
 		 442 aa  52.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  29.95 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  28.44 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  28.76 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  27.88 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  34.9 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05220  diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 501 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  35.35 
 
 		 257 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>