16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4730 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  41.57 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  35.63 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  34.43 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  31.39 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  32.61 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  30.16 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 483 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  32.3 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  36.18 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  31.38 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  31.98 
 
 		 442 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  28.99 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  27.63 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  28.89 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>