18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2763 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  37.31 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  36.65 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  38 
 
 
483 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  32.82 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  31.39 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  35.88 
 
 
273 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  33.86 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  38.75 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  35.88 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  37.25 
 
 
270 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  31.61 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  29.76 
 
 
442 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  32.08 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  30.49 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  32.21 
 
 
2273 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  33.73 
 
 
280 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  28.93 
 
 
251 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>