14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1222 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  484  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  41.36 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  36.32 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  36.77 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  37.85 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  40.59 
 
 		 483 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  37.24 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  40.46 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  33.06 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  31.44 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  31.25 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  31.97 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  31.98 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>