16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8745 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  35.82 
 
 
266 aa  118  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  35.82 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  35.42 
 
 
279 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  37.81 
 
 
259 aa  104  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  37.44 
 
 
306 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  40.91 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  33.46 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  32.84 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  39.39 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  30.92 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  35.71 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  35.08 
 
 
442 aa  63.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  31.23 
 
 
275 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  28.76 
 
 
268 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  31.44 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>