15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4971 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  95.49 
 
 
266 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  35.82 
 
 
282 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  37.12 
 
 
263 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  38.11 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  34.26 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  35.71 
 
 
259 aa  94  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  32.05 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  37.57 
 
 
263 aa  75.9  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  37.86 
 
 
483 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  35.87 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  33.84 
 
 
442 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  33.52 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  27.88 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>