20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2595 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2595  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1737  hypothetical protein  82.97 
 
 		 273 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00159012  normal  0.147089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4030  hypothetical protein  44.36 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117462  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  35.63 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  33.94 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1222  hypothetical protein  36.49 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6895  hypothetical protein  38.71 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000881431  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  34.31 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  36 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4730  hypothetical protein  36.78 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0257772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  31.23 
 
 		 282 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1540  hypothetical protein  32.49 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  33.52 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  36.48 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2763  hypothetical protein  32.2 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0348749  hitchhiker  0.00164472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  33.52 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  35.33 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  34.64 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  32.75 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>