12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2221 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2221  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3418  hypothetical protein  48.53 
 
 
263 aa  226  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0843  hypothetical protein  46.21 
 
 
259 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4971  hypothetical protein  34.26 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744923  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4458  hypothetical protein  34.84 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8745  hypothetical protein  35.42 
 
 
282 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.199675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0670  hypothetical protein  32.72 
 
 
270 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4643  hypothetical protein  33.33 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4143  hypothetical protein  33.14 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1305  hypothetical protein  35.37 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118135  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3135  hypothetical protein  31.66 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00113081  normal  0.0433621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8202  hypothetical protein  32.14 
 
 
483 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.565701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>