228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2938 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2938  OmpA/MotB  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.443593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2962  putative chemotaxis MotB protein  50.9 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2735  flagellar motor protein-like protein  52.86 
 
 		 278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1302  putative chemotaxis MotB protein  50.54 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4172  chemotaxis protein MotB  52.49 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2695  putative chemotaxis MotB protein  49.28 
 
 		 266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3380  chemotaxis protein MotB  48.71 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  37.1 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  35.53 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  34.41 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  35.69 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 		 319 aa  145  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  32.51 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  31.79 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.39 
 
 		 318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 307 aa  138  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  33.22 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  33.69 
 
 		 346 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  33.79 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  31.83 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  34.05 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  35.17 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  32.98 
 
 		 349 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  32.07 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  32.07 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  32.07 
 
 		 339 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  33.45 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  33.45 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  33.45 
 
 		 340 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  33.68 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  32.98 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  32.53 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  33.57 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  32.63 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  31.32 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  31.93 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  32.86 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  31.58 
 
 		 335 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  33.1 
 
 		 339 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  30.9 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  29.86 
 
 		 433 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  29.86 
 
 		 421 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  31.27 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  29.86 
 
 		 451 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  29.39 
 
 		 321 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  30.04 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 		 330 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  29.68 
 
 		 376 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  34.48 
 
 		 327 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  32.03 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  30.88 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  34.53 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 358 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  29.97 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  32.4 
 
 		 377 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  32.27 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  31.8 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  30.56 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  30.56 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  30.56 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  30.56 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  30.56 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  29.62 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  31.8 
 
 		 315 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  31.8 
 
 		 315 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  30.43 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  28.67 
 
 		 336 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  28.72 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  32.95 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  30.5 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  27.53 
 
 		 330 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  28.37 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  31.42 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  31.67 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  30 
 
 		 330 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0202  chemotaxis LafU protein  29.39 
 
 		 311 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  28.83 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>