212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2695 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2695  putative chemotaxis MotB protein  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1302  putative chemotaxis MotB protein  49.45 
 
 
278 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2962  putative chemotaxis MotB protein  49.45 
 
 
278 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2735  flagellar motor protein-like protein  50.55 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.867808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2938  OmpA/MotB  48.81 
 
 
279 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.443593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4172  chemotaxis protein MotB  42.91 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3380  chemotaxis protein MotB  41.7 
 
 
272 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  36.4 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  38.32 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  34.02 
 
 
320 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  35.25 
 
 
335 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  34.15 
 
 
339 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  33.9 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  32.62 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  34.89 
 
 
314 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  35.27 
 
 
320 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  33.9 
 
 
340 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  33.9 
 
 
340 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  33.9 
 
 
340 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  34.53 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  35.29 
 
 
338 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  34.3 
 
 
369 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  34.51 
 
 
339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  34.51 
 
 
339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  34.51 
 
 
339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  33.8 
 
 
339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  34.51 
 
 
338 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 
334 aa  128  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  31.96 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  33.7 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  32.73 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.11 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  32.97 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 
345 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  33.58 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 
307 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  34.43 
 
 
377 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  32.58 
 
 
433 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  32.58 
 
 
451 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  32.58 
 
 
421 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  34.18 
 
 
358 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  33.21 
 
 
376 aa  122  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  31.75 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  34.3 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  33.21 
 
 
308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  34.77 
 
 
327 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  35.6 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  33.09 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  32.46 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  30.18 
 
 
312 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  30.8 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  30.88 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  31.62 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  30.51 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  30.51 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  31.39 
 
 
342 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  32.21 
 
 
308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  32.22 
 
 
341 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  33.81 
 
 
327 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  31.5 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  31.94 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  31.58 
 
 
309 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  31.58 
 
 
309 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  31.58 
 
 
309 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  31.58 
 
 
309 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  31.58 
 
 
309 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  31.02 
 
 
347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 
346 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  30.6 
 
 
355 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  33.21 
 
 
319 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  32.16 
 
 
329 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  32.83 
 
 
330 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  29.6 
 
 
301 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 
315 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  31.13 
 
 
314 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  29.7 
 
 
296 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  31.62 
 
 
315 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  31.62 
 
 
315 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  28.94 
 
 
303 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  28.94 
 
 
303 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.92 
 
 
264 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  28.72 
 
 
330 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  28.18 
 
 
336 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  70.77 
 
 
371 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3631  OmpA/MotB  28.42 
 
 
330 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.77241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  27.82 
 
 
336 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  28.01 
 
 
330 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>