More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0173 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  100 
 
 		 104 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  90.38 
 
 		 117 aa  204  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  93.27 
 
 		 115 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  93.27 
 
 		 115 aa  202  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  84.62 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  84.62 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  85.15 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  85.15 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  85.15 
 
 		 307 aa  183  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  85.15 
 
 		 136 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  85.15 
 
 		 133 aa  183  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  85.15 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  85.15 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  85.15 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  85.15 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  85.15 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  85.15 
 
 		 119 aa  183  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  84.31 
 
 		 336 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  79 
 
 		 115 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  79 
 
 		 115 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  79 
 
 		 115 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  77.88 
 
 		 115 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  77.88 
 
 		 115 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  77.14 
 
 		 117 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  76.19 
 
 		 117 aa  167  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  75.53 
 
 		 98 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  62 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  62 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  68.18 
 
 		 178 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  63 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  63 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  61 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  62 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  58.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  60.2 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.31 
 
 		 251 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  76.67 
 
 		 74 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  52.75 
 
 		 172 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  64.62 
 
 		 97 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.06 
 
 		 252 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.06 
 
 		 252 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  48.94 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  48.94 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  48.94 
 
 		 251 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  48.94 
 
 		 251 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  43.48 
 
 		 252 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  43.48 
 
 		 252 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  44.57 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  44.12 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  44.09 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  44.12 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  44.12 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  44.12 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  44.12 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  42.39 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  41.58 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  85 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  43.48 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.39 
 
 		 659 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.4 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  43.48 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  43.48 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  41.3 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  41.3 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  41.3 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  41.3 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  41.3 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  39.13 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  39.13 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  39.13 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  39.77 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  38.04 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  40.22 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  40.22 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  40.22 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  40.22 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>