More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5031 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  237  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  237  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  84.48 
 
 
117 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  83.62 
 
 
117 aa  204  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  83.48 
 
 
115 aa  202  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  83.48 
 
 
115 aa  202  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  83.48 
 
 
115 aa  202  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  81.08 
 
 
147 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  79.82 
 
 
336 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  81.08 
 
 
307 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  81.08 
 
 
136 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  81.08 
 
 
175 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  81.08 
 
 
133 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  80 
 
 
115 aa  193  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  80 
 
 
115 aa  193  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  81.08 
 
 
119 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  81.08 
 
 
119 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  81.08 
 
 
119 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  81.08 
 
 
119 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  81.08 
 
 
119 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  81.08 
 
 
119 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  79.13 
 
 
117 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  75.65 
 
 
123 aa  190  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  75.65 
 
 
123 aa  190  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  77.88 
 
 
104 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  64.71 
 
 
122 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  64.71 
 
 
122 aa  147  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  63.87 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  60 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  61.06 
 
 
122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  61.34 
 
 
122 aa  144  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  61.34 
 
 
122 aa  144  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  56.52 
 
 
128 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  64.89 
 
 
98 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  82.61 
 
 
178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  60.22 
 
 
97 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  52.88 
 
 
141 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  52.88 
 
 
251 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  52.88 
 
 
251 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  73.61 
 
 
74 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.43 
 
 
252 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  48.57 
 
 
251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  51.43 
 
 
252 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  54.46 
 
 
130 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  47.12 
 
 
252 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  47.12 
 
 
252 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  52 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  45.19 
 
 
141 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  48.04 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  47 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.35 
 
 
659 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  43.43 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  42.31 
 
 
123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  42.31 
 
 
123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  42.31 
 
 
123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  42.31 
 
 
123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  42.31 
 
 
123 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  74.07 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  58.73 
 
 
92 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  87.8 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4814  hypothetical protein  90.24 
 
 
97 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  82.22 
 
 
48 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  40.2 
 
 
254 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  40.2 
 
 
254 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  40.2 
 
 
254 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  40.2 
 
 
254 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  40.2 
 
 
254 aa  80.5  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  40 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  45.24 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  45.24 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  45.24 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  41.18 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  41.18 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  41.18 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.19 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  36.84 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  39 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  39 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  40.2 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  40.2 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  40.2 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  40.2 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  40.2 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  40.2 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>