More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3263 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 
122 aa  247  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 
122 aa  247  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  99.18 
 
 
122 aa  246  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  90.08 
 
 
122 aa  224  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  77.05 
 
 
122 aa  199  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  77.05 
 
 
122 aa  199  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  75.41 
 
 
122 aa  191  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  72.95 
 
 
128 aa  188  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  66.67 
 
 
117 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  93.42 
 
 
97 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  66.67 
 
 
115 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  66.67 
 
 
115 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  63.39 
 
 
115 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  63.39 
 
 
115 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  63.39 
 
 
115 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  64.71 
 
 
115 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  64.71 
 
 
115 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  64.22 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  64.22 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  64.22 
 
 
307 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  64.22 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  64.22 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  64.22 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  64.22 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  64.22 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  64.22 
 
 
119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  64.22 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  62.71 
 
 
336 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  64.22 
 
 
175 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  57.72 
 
 
123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  57.72 
 
 
123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  65.49 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  64.6 
 
 
117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  63 
 
 
104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50.41 
 
 
251 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  56 
 
 
172 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  54.81 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  51 
 
 
142 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  54.81 
 
 
251 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  54.81 
 
 
251 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50.96 
 
 
252 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50.96 
 
 
252 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  49.04 
 
 
252 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  49.04 
 
 
252 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  48.04 
 
 
144 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  46.15 
 
 
141 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  55.45 
 
 
130 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  54.26 
 
 
98 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.08 
 
 
659 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  49.49 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  64.29 
 
 
178 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  63.89 
 
 
74 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  39.84 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  39.84 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  43.14 
 
 
123 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  43.14 
 
 
123 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  43.14 
 
 
123 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  50 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  50 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  50 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  61.9 
 
 
92 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  43.81 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  43.81 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  43.81 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  43.81 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  43.81 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  39.45 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  40.74 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  40.74 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  40.74 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  39.62 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.57 
 
 
252 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  41.28 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  41.28 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  40.74 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  40.74 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  48.24 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6136  transposase, putative  36.07 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.788273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  38.24 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>