193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0311 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  78.87 
 
 		 307 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  77.78 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  77.78 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  77.78 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  77.78 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  77.78 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  77.78 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  77.78 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  77.78 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  77.78 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  77.78 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  78.87 
 
 		 336 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  75 
 
 		 117 aa  116  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  73.61 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  74.65 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  74.65 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  73.61 
 
 		 115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  74.65 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  74.65 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  73.61 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  73.61 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  73.61 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  70.42 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  69.01 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  81.97 
 
 		 178 aa  104  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  76.67 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  65.28 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  63.89 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  63.89 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  63.89 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  63.89 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  63.89 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  63.89 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  62.5 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  76.67 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  60.56 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  59.42 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.05 
 
 		 251 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  48.61 
 
 		 252 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  48.61 
 
 		 252 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  53.62 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50.7 
 
 		 659 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  52.86 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  51.47 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  52.86 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  56.52 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  64.81 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  50.7 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  47.14 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  44.44 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  73.17 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  73.17 
 
 		 48 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  44.93 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  41.67 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  43.28 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  42.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  42.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  43.28 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  43.28 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  42.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  42.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  42.03 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  44.93 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  44.93 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  44.93 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  44.93 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  44.93 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4814  hypothetical protein  63.41 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  50 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  45.76 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  53.06 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  53.06 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  53.06 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  42.03 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  42.03 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  40.28 
 
 		 244 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  43.28 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>