More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0174 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  303  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  98.52 
 
 
136 aa  274  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  274  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  273  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  96.18 
 
 
336 aa  261  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  86.09 
 
 
117 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  87.5 
 
 
115 aa  202  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  87.5 
 
 
115 aa  202  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  81.25 
 
 
123 aa  199  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  81.25 
 
 
123 aa  199  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  81.08 
 
 
115 aa  194  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  81.08 
 
 
115 aa  194  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  79.82 
 
 
117 aa  192  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  80.18 
 
 
115 aa  191  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  80.18 
 
 
115 aa  191  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  80.18 
 
 
115 aa  191  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  78.95 
 
 
117 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  85.15 
 
 
104 aa  184  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  64.22 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  60.55 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  64.22 
 
 
122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  61.47 
 
 
122 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  63.3 
 
 
122 aa  145  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  61.47 
 
 
122 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  61.47 
 
 
122 aa  143  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  87.14 
 
 
178 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  54.78 
 
 
128 aa  137  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  72.34 
 
 
98 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  77.78 
 
 
74 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.56 
 
 
251 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.03 
 
 
252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.03 
 
 
252 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  65.79 
 
 
97 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  98.15 
 
 
121 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  50 
 
 
251 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  52.43 
 
 
141 aa  110  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  54 
 
 
172 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  51.72 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  43.59 
 
 
252 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  43.59 
 
 
252 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  44.35 
 
 
142 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  43.8 
 
 
144 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  43.27 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  48.45 
 
 
130 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.13 
 
 
659 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  82.98 
 
 
65 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  40 
 
 
123 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  40 
 
 
123 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  40 
 
 
123 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  40 
 
 
123 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  97.56 
 
 
48 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  40 
 
 
123 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  45 
 
 
254 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  45 
 
 
254 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  45 
 
 
254 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  45 
 
 
254 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  45 
 
 
254 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.06 
 
 
252 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  44 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  44 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  44 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  44 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  44 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  44 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  41.51 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4814  hypothetical protein  85.37 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  40.74 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  40.74 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  42.16 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  42.16 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  42.16 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  53.97 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  38.79 
 
 
139 aa  76.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  41.18 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>