82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2040 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  100 
 
 
65 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  67.21 
 
 
307 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  76.92 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  76.92 
 
 
133 aa  90.5  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  76.92 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  76.92 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  76.92 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  76.92 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  76.92 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  76.92 
 
 
119 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  82.98 
 
 
175 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  82.98 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  74.07 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  74.07 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  74.07 
 
 
115 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  76.92 
 
 
123 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  76.92 
 
 
123 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  82.98 
 
 
336 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  80 
 
 
117 aa  88.6  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  74.07 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  74.07 
 
 
115 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  73.08 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  78 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  78 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  71.15 
 
 
117 aa  83.6  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  79.55 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  85 
 
 
104 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  64.81 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  60.38 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  80 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  60 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  60 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  60 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  57.41 
 
 
122 aa  66.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  57.41 
 
 
122 aa  66.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  50.94 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  51.85 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  51.85 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  68.18 
 
 
48 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  61.22 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4814  hypothetical protein  65 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  54.17 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  50 
 
 
141 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  50 
 
 
251 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  52.17 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.4 
 
 
252 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.4 
 
 
252 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  47.83 
 
 
251 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  40.82 
 
 
92 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  36.84 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  41.18 
 
 
252 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  41.18 
 
 
252 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  41.18 
 
 
303 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  41.18 
 
 
303 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  41.18 
 
 
303 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  37.74 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  37.74 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  37.74 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  37.74 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  37.74 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  37.74 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  41.3 
 
 
130 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  42.55 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1102  putative transposase  40.38 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.334321 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  45.65 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  45.65 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  45.65 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  45.65 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  45.65 
 
 
254 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>