More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1007 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2059  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 		 123 aa  254  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1007  IS5 family transposase OrfA  100 
 
 		 123 aa  254  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4033  IS5 family transposase OrfA  87.83 
 
 		 115 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3757  IS5 family transposase OrfA  87.83 
 
 		 115 aa  216  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal  0.26823 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4094  IS5 family transposase OrfA  84.35 
 
 		 117 aa  209  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378853  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0174  hypothetical protein  81.25 
 
 		 147 aa  199  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4295  hypothetical protein  81.25 
 
 		 133 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4301  hypothetical protein  81.25 
 
 		 136 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0827  hypothetical protein  81.25 
 
 		 175 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.272641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2132  IstB ATP binding domain-containing protein  81.25 
 
 		 307 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.832687 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3531  hypothetical protein  81.25 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0201586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3539  hypothetical protein  81.25 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.72102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3696  hypothetical protein  81.25 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  0.614374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0172  hypothetical protein  81.25 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3822  hypothetical protein  81.25 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0507  IS5 family transposase  81.08 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1529  IS5 family transposase  81.08 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2759  IS5 family transposase  81.08 
 
 		 115 aa  198  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4289  hypothetical protein  81.25 
 
 		 119 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  81.25 
 
 		 336 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0173  IS5 family transposase  84.62 
 
 		 104 aa  190  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5031  hypothetical protein  75.65 
 
 		 115 aa  190  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.212133  normal  0.750276 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5038  hypothetical protein  75.65 
 
 		 115 aa  190  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799409  normal  0.881755 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4639  IS5 family transposase OrfA  75 
 
 		 117 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4649  IS5 family transposase OrfA  74.14 
 
 		 117 aa  186  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0420  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0598  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0837  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.456928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1299  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.594547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1320  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1526  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1642  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1646  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1688  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2028  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2348  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00257505  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2459  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2607  transposase  56.1 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0530  IS5 family transposase orfA  56.1 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0255453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0534  IS5 family transposase orfA  56.1 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4216  IS5 family transposase OrfA  56.1 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2297  hypothetical protein  71.43 
 
 		 98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2136  IS5 family transposase OrfA  57.72 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3263  IS5 family transposase OrfA  57.72 
 
 		 122 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1595  IS5 family transposase OrfA  56.91 
 
 		 122 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2771  transposase  54.47 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.447174  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7388  transposase  64.77 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.648182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1600  hypothetical protein  63.16 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.28 
 
 		 252 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  46.28 
 
 		 252 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0311  hypothetical protein  74.65 
 
 		 74 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  48.74 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  45.71 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6122  putative transposase  48.78 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  48.74 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0480  putative transposase  49 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  41.32 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1527  putative transposase  45.83 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  41.32 
 
 		 252 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  44.55 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  42.31 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.59 
 
 		 659 aa  97.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  44.55 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2709  putative transposase  40.17 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2040  putative transposase  76.92 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  39.66 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  39.66 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  39.66 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  39.66 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  39.66 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0623  hypothetical protein  53.97 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  39.22 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  39.22 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  39.22 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  39.22 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  39.22 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  82.93 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0938  hypothetical protein  77.78 
 
 		 48 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155979  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  37.93 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  35.25 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  36.29 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  36.29 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4814  hypothetical protein  75.61 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  36.28 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  36.28 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  36.89 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  38.26 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  36.28 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  38.24 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  38.24 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  38.24 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  38.24 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  38.24 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  38.24 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  40.66 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  40.66 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  40.66 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  37.04 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  37.04 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>