More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2043 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2043  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
292 aa  588  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.51 
 
 
312 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.61 
 
 
405 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0850  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.65 
 
 
301 aa  219  5e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.261607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.79 
 
 
320 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.61 
 
 
347 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  41.24 
 
 
305 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  38.91 
 
 
408 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.02 
 
 
416 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.02 
 
 
416 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.4 
 
 
501 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.59 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.51 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.14 
 
 
453 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1588  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.96 
 
 
518 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2324  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.23 
 
 
606 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0944454  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.97 
 
 
310 aa  208  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  39.58 
 
 
495 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0277  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.34 
 
 
546 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  39.58 
 
 
471 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.05 
 
 
331 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.72 
 
 
452 aa  205  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0334  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.34 
 
 
382 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0268  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.16 
 
 
398 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 
373 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.91 
 
 
320 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0386  putative cell division protein  38.81 
 
 
328 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.919397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.26 
 
 
329 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  41.26 
 
 
329 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.26 
 
 
329 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.26 
 
 
329 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0077  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.58 
 
 
281 aa  204  2e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.26 
 
 
329 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.26 
 
 
329 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  41.26 
 
 
329 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.91 
 
 
329 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.87 
 
 
432 aa  203  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0632  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.33 
 
 
410 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255815  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1843  Signal recognition particle-docking protein FtsY  38.33 
 
 
393 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.78 
 
 
301 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.48 
 
 
302 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.85 
 
 
481 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.02 
 
 
295 aa  202  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0241  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.81 
 
 
394 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0492  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.33 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0977518  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.62 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.14 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.91 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2373  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.8 
 
 
343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119612  hitchhiker  0.000783963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2753  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.8 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0216  cell division protein  42.35 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  40.77 
 
 
511 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.91 
 
 
329 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05700  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 
384 aa  200  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00177704  normal  0.0500251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2659  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.38 
 
 
389 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319125  hitchhiker  0.000261917 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1399  signal recognition particle receptor (docking protein)  38.54 
 
 
463 aa  199  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.3 
 
 
514 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3808  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.49 
 
 
499 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3759  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.49 
 
 
499 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2108  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.96 
 
 
324 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  38.19 
 
 
362 aa  199  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.51 
 
 
483 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1563  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.33 
 
 
442 aa  199  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1921  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.1 
 
 
346 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0684564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  40.38 
 
 
491 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  40.38 
 
 
491 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  40.38 
 
 
491 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0075  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.32 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  45.05 
 
 
512 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10090  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.21 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.653732  hitchhiker  0.000000602887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.35 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.19 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  40.38 
 
 
491 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  45.05 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.05 
 
 
497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  37.81 
 
 
541 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  45.05 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  45.05 
 
 
497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1050  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.1 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  45.05 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  45.05 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  45.05 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.68 
 
 
497 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.01 
 
 
510 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0455  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.62 
 
 
382 aa  196  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000410251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.01 
 
 
494 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0308  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.71 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441566  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3476  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.11 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000916186  decreased coverage  0.000245691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  40 
 
 
491 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0578  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 
386 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.74 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.861654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1544  signal recognition particle-docking protein FtsY  36.68 
 
 
391 aa  195  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4140  signal recognition particle-docking protein FtsY  39.93 
 
 
385 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0281  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.6 
 
 
340 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.26 
 
 
413 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  45.05 
 
 
497 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.56 
 
 
329 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1055  cell division protein  37.29 
 
 
397 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0936  signal recognition particle-docking protein FtsY  37.29 
 
 
397 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.49 
 
 
386 aa  195  9e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104653  normal  0.157988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>