More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1995 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1995  magnesium chelatase family protein  100 
 
 
566 aa  1149    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0086  putative Mg chelatase homolog  40.67 
 
 
511 aa  404  1e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.428879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  38.89 
 
 
509 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  39.14 
 
 
510 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  40.04 
 
 
508 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  37.7 
 
 
509 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  38.65 
 
 
512 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  38.1 
 
 
508 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  38.86 
 
 
512 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  38.2 
 
 
509 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  39.28 
 
 
510 aa  369  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  37.84 
 
 
509 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  38.85 
 
 
513 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  38.64 
 
 
512 aa  361  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  37.61 
 
 
509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  38.6 
 
 
510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  38.46 
 
 
507 aa  355  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  37.95 
 
 
506 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  38.34 
 
 
506 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  36.92 
 
 
504 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  36.82 
 
 
513 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  37.12 
 
 
509 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  38.07 
 
 
513 aa  354  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  35.48 
 
 
509 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  38.18 
 
 
509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  37.12 
 
 
509 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  38 
 
 
514 aa  349  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  38.17 
 
 
509 aa  349  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  36.31 
 
 
516 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  37.48 
 
 
509 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  37.34 
 
 
513 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  37.66 
 
 
509 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  37.16 
 
 
512 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  37.45 
 
 
511 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  37.43 
 
 
507 aa  345  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  38.61 
 
 
514 aa  343  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  37.39 
 
 
506 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  37.75 
 
 
506 aa  342  1e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  34.97 
 
 
512 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  34.82 
 
 
512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  36.15 
 
 
510 aa  337  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  35.28 
 
 
505 aa  336  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  37.88 
 
 
511 aa  336  7e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  37.48 
 
 
509 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  37.36 
 
 
499 aa  335  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  36.1 
 
 
497 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  36.87 
 
 
501 aa  332  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  35.62 
 
 
512 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  36.25 
 
 
514 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  37.41 
 
 
513 aa  332  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  37.27 
 
 
511 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  37.16 
 
 
512 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  36.48 
 
 
507 aa  329  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  35.78 
 
 
520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  37.5 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  37.84 
 
 
497 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  36.45 
 
 
518 aa  327  5e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  36.33 
 
 
501 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  36.72 
 
 
508 aa  326  8.000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  37.3 
 
 
505 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  36.35 
 
 
516 aa  325  1e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  36.27 
 
 
498 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  37.48 
 
 
506 aa  324  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  35.42 
 
 
507 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  37.88 
 
 
518 aa  323  5e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  35.41 
 
 
504 aa  323  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  36.72 
 
 
495 aa  323  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  37.06 
 
 
503 aa  322  9.000000000000001e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  35.97 
 
 
501 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  37.18 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  37.36 
 
 
511 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  38.35 
 
 
505 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  35.24 
 
 
507 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  36.22 
 
 
511 aa  320  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  34.79 
 
 
519 aa  320  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  36.07 
 
 
496 aa  319  7e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  37.28 
 
 
505 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  34.87 
 
 
530 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  36.19 
 
 
510 aa  316  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  36.31 
 
 
497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  35.41 
 
 
485 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  35.18 
 
 
512 aa  312  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  35.57 
 
 
498 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  34.58 
 
 
504 aa  311  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  34.7 
 
 
504 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  35.51 
 
 
518 aa  310  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  35.82 
 
 
506 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  36.51 
 
 
510 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  35.05 
 
 
506 aa  307  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1407  Mg chelatase, subunit ChlI  34.61 
 
 
499 aa  307  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0255781  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  36.33 
 
 
504 aa  307  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  34.78 
 
 
549 aa  307  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  35.05 
 
 
506 aa  307  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0338  Mg(2+) chelatase family protein  35.59 
 
 
510 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  34.94 
 
 
510 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  36.75 
 
 
516 aa  306  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0197  Mg chelatase-related protein  35.73 
 
 
497 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  35.19 
 
 
496 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  35.4 
 
 
526 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  34.33 
 
 
517 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>