More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1034 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1034  magnesium and cobalt transporter, putative  100 
 
 
310 aa  631  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00652264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1958  Mg2 transporter protein CorA family protein  42.63 
 
 
310 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000232842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0106  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.04 
 
 
335 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000184046  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2783  Mg2 transporter protein CorA family protein  34.76 
 
 
307 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.053991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2107  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.96 
 
 
381 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.61648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0933  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.72 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0376  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.18 
 
 
351 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00229946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0359  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.81 
 
 
351 aa  90.9  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000101398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1870  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.75 
 
 
363 aa  90.5  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3915  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.92 
 
 
316 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000328218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1811  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.7 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1617  magnesium and cobalt transport protein CorA  32.05 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2074  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.22 
 
 
357 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.26  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0943  Mg2 transporter protein, CorA family protein  27.4 
 
 
322 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1738  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.99 
 
 
352 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.277865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4153  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.21 
 
 
320 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000417339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4194  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.21 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000487176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4217  magnesium and cobalt transport protein CorA  27.21 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000527032  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0173  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.59 
 
 
352 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3012  magnesium and cobalt transport protein CorA  33.82 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.815439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1043  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.82 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000724407  decreased coverage  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0865  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.43 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.916446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.65 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0176371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3994  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.86 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000979692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3825  magnesium and cobalt transport protein  26.86 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.9681200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3841  magnesium and cobalt transport protein  26.86 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4306  magnesium/cobalt transporter CorA  26.86 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000440418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4108  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.86 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.03946e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2783  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.44 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000249719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0252  magnesium and cobalt transport protein CorA  31.65 
 
 
353 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000575717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2937  putative cobalt/magnesium uptake transporter  23.1 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2520  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.02 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00107852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0433  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.46 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3419  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.64 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000222754  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2791  putative cobalt/magnesium uptake transporter  31.43 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1416  magnesium/cobalt transporter CorA  24.83 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1102  magnesium and cobalt transport protein CorA  37.1 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.528236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4037  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.28 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2983  magnesium and cobalt transport protein CorA  39.76 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.23033  normal  0.025318 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1041  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.96 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.78816  normal  0.435904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1189  magnesium/cobalt transporter CorA  38.64 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2424  Mg2 transporter protein CorA family protein  29.15 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0648  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.26 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1938  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.71 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1521  magnesium/cobalt transporter CorA  24.14 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.954015 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1371  magnesium and cobalt transport protein CorA  24.75 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0668  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.26 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0284032  normal  0.71068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10618  Magnesium and cobalt transport protein  21.95 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2417  Mg2 transporter protein CorA family protein  38.82 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0646  magnesium and cobalt transport protein CorA  40.91 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2371  Mg2+ transporter protein, CorA family protein  38.82 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.563119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0267  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.71 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1587  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.18 
 
 
353 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.188358  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1725  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.95 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1006  magnesium and cobalt transport protein CorA  38.37 
 
 
547 aa  77  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1204  Mg2 transporter protein CorA family protein  26.27 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.787899  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0245  Mg2 transporter protein CorA family protein  50 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279376  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2713  magnesium and cobalt transport protein CorA  20.82 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0576  Mg2+ transporter protein, CorA-like  46.97 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0761452  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0787  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.84 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00324534  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0054  magnesium and cobalt transport protein CorA  23.85 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0017  magnesium and cobalt transport protein CorA  44.59 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2768  magnesium and cobalt transport protein CorA  30.61 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0436  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.35 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1262  putative cation transporter  27.3 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0115831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0134  magnesium/cobalt transporter CorA  50.75 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000744017  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1786  magnesium and cobalt transport protein CorA  50 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1992  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.5 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1740  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.71 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1846  magnesium and cobalt transport protein CorA  50 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0143236  hitchhiker  0.00262704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2667  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.35 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2665  magnesium and cobalt transport protein CorA  26.35 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2505  magnesium and cobalt transport protein CorA  50 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0104168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0783  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.89 
 
 
316 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1537  magnesium and cobalt transport protein CorA  49.23 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.34242  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2618  magnesium and cobalt transport protein CorA  50 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240345  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2498  magnesium and cobalt transport protein CorA  50 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0365277  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0341  hypothetical protein  38.89 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1294  magnesium and cobalt transport protein CorA  29.17 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0696  magnesium and cobalt transport protein CorA  40 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2244  magnesium and cobalt transport protein CorA  45.68 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000192841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1581  magnesium/cobalt transporter CorA  23.21 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0107279  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2182  magnesium and cobalt transport protein CorA  41.86 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.709225  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2259  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.44 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1913  magnesium and cobalt transport protein CorA  21.75 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1720  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.44 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00013854  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2408  magnesium and cobalt transport protein CorA  22.3 
 
 
339 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1576  magnesium and cobalt transport protein CorA  25.98 
 
 
323 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.547991  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0128  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  44.74 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.273225  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3662  magnesium and cobalt transport protein  23.99 
 
 
358 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4163  magnesium and cobalt transport protein CorA  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1941  magnesium and cobalt transport protein CorA  48.44 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4183  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0150126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4041  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4335  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4280  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5256  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03641  hypothetical protein  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3948  magnesium and cobalt transport protein CorA  35.48 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643158  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4162  magnesium/nickel/cobalt transporter CorA  43.42 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>