24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13514 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  100 
 
 
1031 aa  2043    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  33.56 
 
 
1142 aa  327  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  38.16 
 
 
1101 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  33.17 
 
 
954 aa  171  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  39.09 
 
 
978 aa  170  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  33.33 
 
 
1383 aa  154  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  33.66 
 
 
1153 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  35.4 
 
 
1320 aa  128  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  31.92 
 
 
818 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  28.05 
 
 
1107 aa  103  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  28.23 
 
 
1137 aa  100  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  28.61 
 
 
1056 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  27.98 
 
 
1171 aa  97.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  29.07 
 
 
818 aa  94.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  31.8 
 
 
926 aa  94.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  26 
 
 
773 aa  75.1  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  28.02 
 
 
816 aa  67.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  26.88 
 
 
828 aa  64.7  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  37.04 
 
 
770 aa  60.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  37.27 
 
 
774 aa  55.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  33.33 
 
 
818 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  33.61 
 
 
825 aa  50.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  28.84 
 
 
563 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  28.23 
 
 
830 aa  48.5  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>