24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2615 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2615  patatin  100 
 
 		 926 aa  1841    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  29.89 
 
 		 1107 aa  353  7e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  36.77 
 
 		 1137 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  41.42 
 
 		 1171 aa  274  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  27.66 
 
 		 825 aa  191  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  28.3 
 
 		 774 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  26.72 
 
 		 818 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  26.14 
 
 		 818 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  26.81 
 
 		 816 aa  157  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  26.07 
 
 		 830 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  31.09 
 
 		 828 aa  148  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  31.75 
 
 		 1056 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  30 
 
 		 773 aa  131  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  37.65 
 
 		 1320 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  32.1 
 
 		 1383 aa  104  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  31.39 
 
 		 818 aa  101  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  31.75 
 
 		 1153 aa  99.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  28.17 
 
 		 954 aa  95.1  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  31.25 
 
 		 978 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  29.75 
 
 		 770 aa  86.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  27.9 
 
 		 1101 aa  63.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1031 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1142 aa  57  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  26.43 
 
 		 563 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>