23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0030 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  52.75 
 
 		 773 aa  708    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  100 
 
 		 770 aa  1511    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  51.8 
 
 		 774 aa  732    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  40.9 
 
 		 818 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  33.76 
 
 		 825 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  36.09 
 
 		 828 aa  364  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  31.98 
 
 		 816 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  33.56 
 
 		 830 aa  340  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  27.6 
 
 		 818 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  28.41 
 
 		 1137 aa  177  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  29.89 
 
 		 1171 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  29.41 
 
 		 926 aa  154  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  24.92 
 
 		 1107 aa  147  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  26.17 
 
 		 1056 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  27.65 
 
 		 954 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  29.98 
 
 		 818 aa  99.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  27.31 
 
 		 978 aa  98.6  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  25.63 
 
 		 1153 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  27.51 
 
 		 1383 aa  75.5  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  26.54 
 
 		 1320 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1142 aa  62  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1031 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  39.34 
 
 		 1101 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>