23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5555 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5555  patatin  100 
 
 		 954 aa  1885    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  55.09 
 
 		 978 aa  920    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  36.59 
 
 		 1320 aa  225  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  32.74 
 
 		 1153 aa  214  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  35.99 
 
 		 1142 aa  178  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  35.81 
 
 		 1101 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  33.09 
 
 		 1031 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  26.4 
 
 		 1056 aa  128  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  30.69 
 
 		 818 aa  127  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  27.16 
 
 		 1171 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  25.71 
 
 		 926 aa  115  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  25.47 
 
 		 1137 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  28.37 
 
 		 818 aa  103  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  26.2 
 
 		 818 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  28.33 
 
 		 1107 aa  97.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  27.85 
 
 		 773 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  28.16 
 
 		 770 aa  89  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  25.79 
 
 		 816 aa  85.9  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  27 
 
 		 825 aa  83.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  39.07 
 
 		 1383 aa  82  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  25.9 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  26.75 
 
 		 830 aa  74.7  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  38.33 
 
 		 774 aa  67.4  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>