24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0045 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  40.49 
 
 		 1171 aa  780    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  100 
 
 		 1107 aa  2300    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  30.04 
 
 		 926 aa  358  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  35.59 
 
 		 1137 aa  352  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  25.11 
 
 		 773 aa  169  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  25.4 
 
 		 770 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  23.61 
 
 		 828 aa  160  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  28.67 
 
 		 818 aa  151  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  28.54 
 
 		 825 aa  147  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  24.47 
 
 		 830 aa  147  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  32.6 
 
 		 818 aa  145  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  25.28 
 
 		 816 aa  143  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  28.76 
 
 		 774 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  27.62 
 
 		 1056 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  27.37 
 
 		 1153 aa  105  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  28.33 
 
 		 954 aa  98.6  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  28.21 
 
 		 978 aa  95.1  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  26.42 
 
 		 1320 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  26.54 
 
 		 1383 aa  89  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  25.47 
 
 		 818 aa  86.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  23.67 
 
 		 1101 aa  77  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1031 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1142 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  21.93 
 
 		 563 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>