20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5025 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  100 
 
 		 563 aa  1151    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2063  patatin  29.33 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.028866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0279  hypothetical protein  25.3 
 
 		 585 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1351  patatin  26.04 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0887  patatin  26.16 
 
 		 589 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  25.13 
 
 		 818 aa  62  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  23.64 
 
 		 818 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  26.43 
 
 		 926 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  23.32 
 
 		 1171 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1304  hypothetical protein  23.85 
 
 		 725 aa  53.5  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  22.89 
 
 		 1137 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  21.93 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3201  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1097 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3101  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1108 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.416188  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  23.14 
 
 		 343 aa  47.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  24.58 
 
 		 1320 aa  47.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  37.8 
 
 		 421 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  25.81 
 
 		 1153 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3296  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1095 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  26.78 
 
 		 774 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>