24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1083 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1083  patatin  100 
 
 		 818 aa  1667    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  37.18 
 
 		 825 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  37.23 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  37.67 
 
 		 828 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  38.95 
 
 		 774 aa  490  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  35.32 
 
 		 816 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  40.34 
 
 		 770 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  38.93 
 
 		 773 aa  458  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  27.44 
 
 		 818 aa  226  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  25.45 
 
 		 1107 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  27.47 
 
 		 1137 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  26.72 
 
 		 926 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  27.75 
 
 		 1171 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  25.76 
 
 		 1056 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  26.2 
 
 		 954 aa  101  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  24.12 
 
 		 978 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  28.54 
 
 		 1153 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  28.37 
 
 		 1101 aa  75.5  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  42.45 
 
 		 818 aa  73.9  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  26.88 
 
 		 1383 aa  63.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  25.13 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  23 
 
 		 1320 aa  55.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1031 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1142 aa  53.5  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>