22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2089 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  53.17 
 
 		 828 aa  848    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  72 
 
 		 825 aa  1201    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  100 
 
 		 830 aa  1684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  65.82 
 
 		 816 aa  1104    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  37.44 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  32.9 
 
 		 774 aa  362  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  37.28 
 
 		 773 aa  259  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  37.37 
 
 		 770 aa  249  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  26.31 
 
 		 818 aa  173  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  26.07 
 
 		 926 aa  167  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  29.32 
 
 		 1137 aa  158  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  28.77 
 
 		 1171 aa  144  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  26.74 
 
 		 1107 aa  143  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  23.08 
 
 		 1056 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  26.76 
 
 		 1153 aa  87.8  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  27.97 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  25.59 
 
 		 978 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  38.97 
 
 		 1101 aa  75.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  26.75 
 
 		 954 aa  75.1  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  25.63 
 
 		 1383 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1031 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1142 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>