24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3961 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  100 
 
 		 1056 aa  2157    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  31.46 
 
 		 1171 aa  149  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  31.85 
 
 		 1137 aa  149  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  31.75 
 
 		 926 aa  142  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  29.7 
 
 		 1153 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  27.12 
 
 		 954 aa  129  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  27.52 
 
 		 1107 aa  124  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  30.65 
 
 		 1383 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  25.76 
 
 		 818 aa  118  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  27.87 
 
 		 818 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  25.63 
 
 		 773 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  28.35 
 
 		 1320 aa  107  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  23.64 
 
 		 825 aa  106  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  26.81 
 
 		 818 aa  104  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  26.17 
 
 		 770 aa  104  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  24.18 
 
 		 816 aa  102  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  23.41 
 
 		 828 aa  102  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  24.34 
 
 		 978 aa  101  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  25.74 
 
 		 1101 aa  97.8  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  22.58 
 
 		 774 aa  92.8  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  25 
 
 		 1142 aa  92.4  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  23.08 
 
 		 830 aa  92  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1031 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0279  hypothetical protein  23.34 
 
 		 585 aa  50.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>