23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2776 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  100 
 
 
1383 aa  2717    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  39.05 
 
 
1320 aa  325  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  38.38 
 
 
1153 aa  192  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  40.17 
 
 
978 aa  174  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  36.59 
 
 
818 aa  133  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  32.39 
 
 
1101 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  32.58 
 
 
1142 aa  121  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  30.85 
 
 
1056 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  33.33 
 
 
1031 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  28.37 
 
 
1171 aa  113  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  32.1 
 
 
926 aa  104  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  26.88 
 
 
1137 aa  102  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  29.44 
 
 
818 aa  99.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  26.54 
 
 
1107 aa  89  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  37.93 
 
 
954 aa  84  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  41.59 
 
 
774 aa  66.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  24.82 
 
 
773 aa  64.3  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  24.56 
 
 
825 aa  63.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  27.36 
 
 
818 aa  62.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  24.52 
 
 
816 aa  62  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  41.07 
 
 
770 aa  61.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  25.38 
 
 
830 aa  58.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  27.82 
 
 
828 aa  52  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>