54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10844 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10844  transposase  100 
 
 
96 aa  196  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.40887e-17  hitchhiker  0.000000069581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12899  transposase  97.85 
 
 
460 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0267522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12993  transposase  82.98 
 
 
459 aa  160  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000929698  normal  0.662784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12804  transposase  78.72 
 
 
459 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00653678  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  46.67 
 
 
370 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  46.67 
 
 
393 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1615  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  42.86 
 
 
420 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00623083  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3743  transposase  44.44 
 
 
300 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  52.38 
 
 
461 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  44.44 
 
 
370 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  52.38 
 
 
394 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  52.38 
 
 
394 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  44.44 
 
 
393 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4972  IS891/IS1136/IS1341 transposase  52.38 
 
 
402 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3275  transposase  44.83 
 
 
405 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  42.22 
 
 
370 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  42.22 
 
 
370 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  44.44 
 
 
370 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  44.44 
 
 
311 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  44.44 
 
 
370 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1966  transposase, IS605 OrfB  42.86 
 
 
267 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0685  IS605 family transposase OrfB  39.39 
 
 
442 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1540  IS605 family transposase OrfB  48.78 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5677  IS605 family transposase OrfB  39.39 
 
 
442 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  42.22 
 
 
304 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1563  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 
402 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1629  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 
402 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0401  transposase  50 
 
 
402 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
404 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  38.46 
 
 
404 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1764  IS605 family transposase OrfB  36.99 
 
 
402 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0263  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 
382 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00049231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
385 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  42.22 
 
 
370 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2321  transposase, IS605 OrfB family  42.22 
 
 
374 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  40.68 
 
 
405 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  40.68 
 
 
405 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  47.62 
 
 
399 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  40.68 
 
 
386 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1623  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 
377 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.139017  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  50 
 
 
385 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3217  transposase  40 
 
 
394 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  40.91 
 
 
370 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  45.45 
 
 
440 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  46.34 
 
 
391 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 
383 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  40 
 
 
370 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  45.45 
 
 
403 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  47.62 
 
 
384 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 
383 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 
383 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 
383 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  38.3 
 
 
383 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2858  transposase, IS605 OrfB family  37.7 
 
 
376 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.551858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>