43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1358 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  53.99 
 
 		 298 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  53.24 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  53.73 
 
 		 277 aa  293  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  50.18 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  49.64 
 
 		 287 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  49.64 
 
 		 287 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  47.1 
 
 		 286 aa  271  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  49.63 
 
 		 283 aa  270  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  50.55 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  48.08 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  36.7 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  44.31 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  41.34 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.14 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  42.16 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  33.99 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  43.23 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  34.22 
 
 		 1152 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  39.08 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  31.41 
 
 		 1185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1046  zinc finger SWIM domain protein  34.21 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0821435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.55 
 
 		 366 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  30.91 
 
 		 376 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  27.81 
 
 		 1175 aa  93.2  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  36.42 
 
 		 1194 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.07 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0606  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.9 
 
 		 359 aa  89  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  28.28 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  27.75 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  34.97 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  29.81 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2838  zinc finger, SWIM-type  30.25 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  29.19 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0502304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  28.04 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1674  zinc finger, SWIM-type  22.78 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.57 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  30.99 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0842  zinc finger SWIM domain protein  30.3 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.506869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2280  zinc finger SWIM domain protein  31.3 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  25.88 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1216  zinc finger SWIM domain protein  26.14 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1928  SWIM Zn-finger  41.18 
 
 		 613 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>