42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1607 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  56.2 
 
 
277 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  51.6 
 
 
283 aa  301  9e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  52.69 
 
 
286 aa  300  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  51.99 
 
 
287 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  51.99 
 
 
287 aa  291  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  48.24 
 
 
285 aa  279  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  48.08 
 
 
263 aa  242  6e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  43.6 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  39.46 
 
 
297 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  40.75 
 
 
301 aa  222  7e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  39.3 
 
 
294 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  47.13 
 
 
317 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.68 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.43 
 
 
302 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.43 
 
 
323 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  39.01 
 
 
277 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  42.11 
 
 
292 aa  148  9e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
1152 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  39.39 
 
 
253 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  35.71 
 
 
1185 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1046  zinc finger SWIM domain protein  33.58 
 
 
328 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0821435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  30.47 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  32.93 
 
 
366 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0606  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.33 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  31.18 
 
 
271 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  31.05 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  28.75 
 
 
1175 aa  97.4  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.79 
 
 
277 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1674  zinc finger, SWIM-type  23.44 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14188  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  32.08 
 
 
376 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2838  zinc finger, SWIM-type  29.55 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  30.86 
 
 
333 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0502304 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  31.95 
 
 
217 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  31.85 
 
 
1194 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.4 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  29.82 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0842  zinc finger SWIM domain protein  29.7 
 
 
229 aa  63.9  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.506869  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  25.45 
 
 
258 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1216  zinc finger SWIM domain protein  26.95 
 
 
265 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2280  zinc finger SWIM domain protein  26.32 
 
 
244 aa  60.1  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>