31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2280 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2280  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 244 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  39.85 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.64 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1046  zinc finger SWIM domain protein  35.76 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0821435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  33.68 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  28.41 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  36.64 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.42 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  34.56 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  26.8 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  25.47 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  33.07 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  28.33 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  22.47 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  21.91 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  25.58 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  31.3 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  26.32 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  27.81 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 1152 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  31.4 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  27.48 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  29.75 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  24.53 
 
 		 1175 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  20.81 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1674  zinc finger, SWIM-type  25.33 
 
 		 297 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  27.69 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.67 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  25.56 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  25.17 
 
 		 333 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0502304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  22.7 
 
 		 1185 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>