43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1197 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  66.31 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  65.95 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  57.35 
 
 		 277 aa  339  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  56.18 
 
 		 283 aa  329  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  51.44 
 
 		 286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  49.3 
 
 		 307 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  50.55 
 
 		 263 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  46.59 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  45.23 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  45.2 
 
 		 297 aa  251  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  39.81 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  45.76 
 
 		 317 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.78 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.25 
 
 		 323 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  35.92 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  45.51 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  40.35 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  35.98 
 
 		 1152 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  37.06 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  36.6 
 
 		 1185 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1046  zinc finger SWIM domain protein  35.54 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0821435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.64 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  34.83 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0606  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.12 
 
 		 359 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000222918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  33.12 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2838  zinc finger, SWIM-type  33.99 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  30.18 
 
 		 1175 aa  103  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.55 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  29.21 
 
 		 296 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  32.03 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  30.77 
 
 		 1194 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  30.12 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  28.4 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0502304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1674  zinc finger, SWIM-type  25.15 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14188  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  34.04 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.16 
 
 		 226 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  27.46 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1216  zinc finger SWIM domain protein  26.06 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0842  zinc finger SWIM domain protein  30.97 
 
 		 229 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.506869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2280  zinc finger SWIM domain protein  28.33 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  26.35 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0504  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.14 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>