43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6254 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  45.76 
 
 		 285 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  44.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  45.6 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  46.29 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  45.56 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  45.56 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  45.09 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  34.51 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  43.85 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.89 
 
 		 283 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  47.25 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  42.27 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  46.2 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  44.31 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  38.92 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  38.18 
 
 		 1152 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  37.84 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  39.52 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  38.46 
 
 		 1185 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1046  zinc finger SWIM domain protein  40.48 
 
 		 328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0821435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  38.32 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0606  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.9 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  36.04 
 
 		 271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  32.72 
 
 		 1175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.56 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  37.91 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  40.74 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  33.82 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0502304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2838  zinc finger, SWIM-type  35.4 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  34.15 
 
 		 376 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  32.09 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  30.39 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1674  zinc finger, SWIM-type  29.19 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  35.67 
 
 		 1194 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  34.67 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0842  zinc finger SWIM domain protein  35.62 
 
 		 229 aa  89.7  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.506869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.49 
 
 		 226 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  26.76 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  30.43 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2280  zinc finger SWIM domain protein  33.33 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0504  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.13 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1216  zinc finger SWIM domain protein  29.89 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>