42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0139 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.46 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  27.17 
 
 		 287 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  27.17 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.9 
 
 		 302 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  30.29 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  31.84 
 
 		 317 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  33.15 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  28.16 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  24.88 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 1152 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  27.06 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.9 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  28.4 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1046  zinc finger SWIM domain protein  38.29 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0821435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1674  zinc finger, SWIM-type  26.35 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  35.09 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  26.44 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  26.67 
 
 		 1175 aa  70.5  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  28.72 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  29.63 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  26.87 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  27.75 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0606  zinc finger SWIM domain-containing protein  28.12 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0842  zinc finger SWIM domain protein  31.69 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.506869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  29.09 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  26.62 
 
 		 1185 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  29.7 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  26.34 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  27.53 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2838  zinc finger, SWIM-type  27.49 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  28.25 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0502304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  27.5 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0504  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.54 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  24.14 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  32.92 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  35.1 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  30.25 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.19 
 
 		 1194 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  30.86 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2280  zinc finger SWIM domain protein  36.05 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.269362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>