39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0842 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0842  zinc finger SWIM domain protein  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.506869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7278  zinc finger, SWIM-type  44.14 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0502304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0419  zinc finger SWIM domain protein  43.69 
 
 		 376 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1095  zinc finger, SWIM-type  43.69 
 
 		 324 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56459  normal  0.142264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2838  zinc finger, SWIM-type  39.82 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0606  zinc finger SWIM domain-containing protein  37.9 
 
 		 359 aa  175  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4058  zinc finger SWIM domain-containing protein  43.69 
 
 		 277 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.304195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0806  zinc finger SWIM domain-containing protein  42.01 
 
 		 366 aa  165  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1236  zinc finger SWIM domain-containing protein  38.2 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.724844  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0052  zinc finger SWIM domain protein  31.61 
 
 		 294 aa  93.2  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0903  hypothetical protein  37.08 
 
 		 292 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6254  zinc finger SWIM domain protein  35.62 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3581  zinc finger SWIM domain protein  32.6 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1152 aa  79.3  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1012  zinc finger SWIM domain protein  33.33 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3362  zinc finger SWIM domain-containing protein  34.34 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0916312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3602  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.74 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  32.08 
 
 		 1185 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1433  hypothetical protein  30.05 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0616369  normal  0.405263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0750  SWIM Zn-finger  28.4 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  30.34 
 
 		 1175 aa  70.1  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0457  zinc finger, SWIM-type  31.82 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.717379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1197  zinc finger SWIM domain protein  30.97 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13835 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  32 
 
 		 1194 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0139  zinc finger SWIM domain-containing protein  31.69 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.389812  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2440  zinc finger SWIM domain protein  29.09 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12136  hypothetical protein  28.48 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.79135e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1358  hypothetical protein  30.3 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1607  zinc finger SWIM domain protein  29.7 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2176  hypothetical protein  30.63 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28391  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00491  hypothetical protein  29.38 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1073  zinc finger SWIM domain-containing protein  27.16 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2829  zinc finger SWIM domain protein  27.39 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3269  zinc finger SWIM domain protein  27.39 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.773769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3287  zinc finger SWIM domain protein  31.85 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1216  zinc finger SWIM domain protein  28.1 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03220  SWIM zinc finger-containing protein  45.24 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.396624  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1868  zinc finger, SWIM-type  32.5 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>